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desde febrero, 2012

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BIENVENIDOS


Rhizogenómica es la página del Programa de Genómica Funcional de Procariotes del Centro de Ciencias Genómicas de la UNAM.

El Jefe del Programa es el Dr. Jaime Mora Célis.

La misión de este portal es presentar la información referente a nuestros Proyectos de Investigación actuales, así como catalogar, exponer y difundir la información acerca de los análisis que realizamos, las publicaciones y los scripts de cómputo para desarrollar diversas tareas de bioinformática.

En la sección de Material Recomendado se encuentran los documentos y herramientas que preparamos recientemente y están disponibles de forma gratuita, así como los artículos de investigación publicados por personal del Programa.

lunam

Universidad Autónoma de México

lccg

Centro de Ciencias Genómicas

libt

Instituto de Biotecnología

lbib

Biblioteca CCG-IBT

lnnb

Nodo Nacional de Bioinformática


MATERIAL RECOMENDADO


herramientas

Análisis bioinformático en la genómica comparativa de Rhizobiales . Este documento muestra las estrategias en el desarrollo del Proyecto de Genómica comparativa de Rhizobiales y las herramientas que fueron esenciales para los análisis correspondientes. En la obra se explica cada aplicación empleada, se describen los detalles acerca de su utilidad y los resultados generados. En este Portal se encuentran los enlaces a los scripts referidos y se pueden descargar y usar libremente.

peralta

Sequence variability of Rhizobiales orthologs and relationship with physico-chemical characteristics of proteins . En este trabajo se buscó definir cómo la adaptación en los genes ortólogos modificó las propiedades de las proteínas codificadas. Encontramos que la diversificación de los genes ortólogos provocó cambios físico-químicos específicos en las proteínas de las especies estudiadas de Rhizobiales, revelando las tendencias particulares que se requieren para llevar a cabo sus funciones en respuesta a la adaptación particular a sus nichos, así como a las condiciones intracelulares de cada organismo. Este artículo se publicó en octubre de 2011 en Biology Direct.

diaz

argC Orthologs from Rhizobiales Show Diverse Profiles of Transcriptional Efficiency and Functionality in Sinorhizobium meliloti . Este trabajo es una aplicación experimental del enfoque acerca de la firma de la especie. Propusimos que la adaptación de los ortólogos puede medirse a través de esta firma y que los residuos responden a las particularidades de cada especie. Al intercambiar un gene ortólogo esencial de la vía de síntesis de arginina (argC) y expresarlo en S. meliloti, se observaron diferentes capacidades de complementación, así como cambios en la expresión transcripcional, actividad de la enzima ArgC y producción de la proteína. Este artículo se publicó en enero de 2011 en el Journal of Bacteriology.

linfluenza

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